第312章 陈师弟牛逼 (第2/3页)
的磷酸化水平随时间变化的轨迹。
通过分析这些轨迹之间的时间先后顺序和协变关系,因果关系的推断变得前所未有的清晰,是A蛋白的激活 consistently发生在B蛋白之前,那么A是B因的可能性就极大提高了。
迷雾瞬间散开!
动态模型清晰地显示,特定的EGFR突变体首先快速招募并激活了一个适配器蛋白,然后这个适配器蛋白在某个特定时间点意外地激活了PKCδ,PKCδ进而绕过经典的RAS蛋白,直接磷酸化并激活了下游的RAF同工酶,从而抄近路驱动了整个促增殖通路。
陈辉很快找到了一条经过动态时间序列数据验证的、高置信度的非经典通路模型,突变EGFR->Gab1->PKCδ->CRAF->MEK->ERK。
他还利用这个模型预测了几个关键节点,如果抑制PKCδ,就应该能特异性地阻断这条非经典通路,逆转耐药性,他甚至还预测了抑制后下游各蛋白磷酸化水平下降的先后顺序和大致幅度。
……
早上八点,唐剑准时来到实验室,提着新鲜的豆浆油条往小会议室走去。
吱呀,
还不等唐剑走进会议室,会议室的门就被推开,陈辉从里面走了出来。
唐剑愣在原地,眼睛一点点睁大。
陈辉在会议室中待了一个多月了,从来没有出来过,现在他出来,是不是意味着,模型构架成功了?
“通知宋教授,准备验证吧!”
陈辉没有卖关子,接过唐剑手中的豆浆油条,自顾自的大快朵颐起来。
八点半,
华夏医学科学院,国家重点肿瘤研究实验室,
二十三人的团队齐聚一堂,大家齐聚大会议室。
“真的假的,他真的完成了模型的构建?”
直到现在,除了唐剑之外,其他师弟师妹们依旧持怀疑态度。
“这么大阵仗,不能是假的吧。”
另一位师弟说到,他不敢想象若那个本科生真是撒谎,到底会闯下多大的祸。
“如果是真的……”
有师弟双眼精光爆闪,“那我们岂不是赶上好时候了。”
他们进行这个研究已经三年了,自然知道它的价值,如果真能证实他们的猜想,这个成果必然是世界级的,以后他们将成为这个领域的绝对权威。
“先别做梦了,看看验证结果再说吧……”
“好了,模型的仿真结果大家都已经看到了,接下来我们需要使用Western Blot技术进行靶点确认。”
宋朝明站在会议室最前方,拍了拍手,等到会议室安静下来,才开口说道。
他们需要重复陈辉模型中最关键的起点,确认在他们的特定EGFR突变细胞系中,PKCδ的磷酸化水平确实在用药后异常升高,且时间点与预测吻合。
这是一切的基础,只有完成了靶点确认,他们才能进行下一步实验。
很快,宋朝明安排好实验分工,众人一哄而散,穿上实验服进入实验室,虽然心中依旧有些迟疑,但他们也迫不及待的想看到最后的验证结果。
可惜生物实验与其他实验还有一些不同,它需要时间的沉淀,无法速成。
实验紧张而有序地展开,培养箱日夜运行,实验室的灯常常亮到深夜。
直到三天后,Western Blot结果才出来,
当那张暗房里显影的胶片被拿出来时,负责的实验员几乎是小跑着拿去给宋朝明。
结果清晰无比,在用药后1小时和6小时,PKCδ的磷酸化条带果然比对照组明显更浓!模型的第一步预测被完美证实!
实验室里响起一阵小小的欢呼,所有人看向陈辉的眼神都变了,有因为之前怀疑的愧疚,也有因为陈辉惊人实力而产生的狂热崇拜。
“陈师弟牛逼!”
不知道哪位师弟忽然激动的大喊了一声。
“陈师弟牛逼!”
很快,这样的欢呼就充满了实验室。
宋朝明脸上也露出了欣慰的笑容,他这所重点实验室,已经很久没有经历过如此热烈的欢呼了。
“好了,这只是第1步,最关键的还在后面呢。”
等了几分钟,等到大家将兴奋的情绪宣泄以后,宋朝明才再次开口说道。
接下来他们需要进行功能获得/丧失实验,首先,他们需要设计并合成针对PKCδ基因的siRNA,转染进癌细胞,特异性沉默PKCδ的表达。
使用一种已知的、较为特异的PKCδ抑制剂比如R
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